Níže jsou uvedena nejdůležitější onemocnění nebo komplikace (např. Invazivní pneumokokové onemocnění, IPE), ke kterým může pneumokokové onemocnění přispívat:
Dýchací systém (J00-J99)
- Plicní emfyzém - abnormální vzestup vzduchu v plicích.
- Pneumonie (zánět plic)
Infekční a parazitární nemoci (A00-B99).
- Sepse (krev otrava) - zejména u osob, které podstoupily splenektomii (splenektomii).
Psychika - nervový systém (F00-F99; G00-G99).
- Zápal mozkových blan (meningitida).