Nedostatek kyseliny alfa-linolenové vede ke snížené přeměně na kyselina eikosapentaenová (EPA) a také kyselina dokosahexaenová (DHA). Mohou tedy nastat změny ve složení buněčných membrán i zvýšené zánětlivé reakce. Mohou se objevit následující příznaky nedostatku: Zhoršené vidění, zhoršené hojení ran, kůže a zánět pokožky hlavy, neurologické poruchy, jako je depresea svalová slabost.
