Následují nejdůležitější nemoci nebo komplikace, ke kterým mohou přispět infekce virem Coxsackie:
Endokrinní, výživové a metabolické nemoci (E00 - E90).
- Diabetes mellitus typu 1
- Tyreoiditida (zánět štítné žlázy)
Kůže a podkožní (L00 - L99)
- Získaná onychodystrofie (patologický růst nehtů) jak velkých nehtů na nohou s onychomadézou (proximální oddělení nehtové ploténky od nehtového lůžka), tak leukonychií (bílé skvrny na nehtech) sekundárně po nemoci slintavky a kulhavky spojené s Coxsackie A6 (pozdní komplikace) )
Kardiovaskulární systém (I00-I99).
- Myokarditida (zánět srdce sval).
- Perikarditida (zánět osrdečníku)
Psychika - nervový systém (F00-F99; G00-G99)
- Zápal mozkových blan (meningitida).
- Meningoencefalitida (kombinovaný zánět mozku (encefalitida) a meningy (zápal mozkových blan)).
- Ochrnutí