Následují nejdůležitější nemoci nebo komplikace, ke kterým může Whippleova choroba přispět:
Oči a oční přídavky (H00 - H59).
Kardiovaskulární systém (I00 - I99)
- Endokarditida (zánět endokardu; druhé nejčastější místo).
- Myokarditida (zánět srdce sval).
- Perikarditida (zánět perikardium) s chlopňovou nedostatečností.
Muskuloskeletální systém a pojivové tkáně (M00-M99).
- Polyartritida (zánět několika klouby).
- Synovialitida (zánět synoviální membrány)
Psychika - nervový systém (F00-F99; G00-G99)
- Amnézie (ztráta paměti)
- Ataxie (porucha chůze)
- Pohled ochrnutí
- Demence
- Epilepsie (záchvaty)
- Rušený rytmus spánku a bdění
Příznaky a abnormální klinické a laboratorní nálezy nezařazené jinde (R00 - R99).
- Zánět pohrudnice (zánět pohrudnice).